Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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