Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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