Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms