Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms