Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPTX1Q15818 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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