Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms