Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARHGEF6Q15052 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARHGEF6Q15052 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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