Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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