Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms