Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNC3Q14003 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms