Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA7Q13683 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms