Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSTA3Q13630 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms