Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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