Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBB3Q13509 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB3Q13509 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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