Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TOP3AQ13472 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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