Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XRCC4Q13426 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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