Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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