Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMD2Q13200 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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