Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHAF1BQ13112 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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