Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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STRN3Q13033 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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