Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms