Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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