Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPN13Q12923 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PTPN13Q12923 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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