Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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