Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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