Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms