Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABPB1Q06547 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms