Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms