Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms