Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363.5 ms