Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms