Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms