Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms