Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms