Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX1P78414 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX1P78414 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms