Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RPL39P62891 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RPL39P62891 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPL39P62891 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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