Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DCDC1P59894 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms