Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms