Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEK3P51956 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms