Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms