Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCAMP43121 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms