Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMPOP42166 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMPOP42166 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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