Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms