Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KDELR1P24390 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KDELR1P24390 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms