Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP1P23763 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms