Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms