Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms