Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCATO75600 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCATO75600 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCATO75600 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCATO75600 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCATO75600 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms