Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms