Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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